
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物技术 为其提供 TMT淀粉酶组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
设计然而
探索技术人员研究性渐渐速冻时期延迟牛羊肉的光洁度、持反击式水轮机、色彩、自由铁含磷量、ROS、脂质过被金属氧化物、MDA、GSH和GPX4横向来考评全身肌肉组织结构血细胞系的铁枯死动态。成果展现,速冻时期延迟后,牛羊肉的光洁度在第5天和第6天偏态增涨;持水程度降底;色彩变深,逐渐耗尽有光泽度,鲜粉色变的暗粉色。不仅,自由铁、化学活化氧和MDA的含磷量偏态增高,血细胞系凋亡率偏态增高。 设计成员分离出来有区别保温日子的身体健身肌肉试品的球营养素,其次实行SDS-PAGE阐述,球营养素条带在有区别晚唐时期分布点饱满且相同(图1a)。随着球淀粉酶在有区别试品中的传达情况发生,阐述察觉一个组试品的中六位数临近于一个总体水平(图1b),证明身体健身肌肉试品球营养素兼有优质的组内相同性和组间区别性。 膳食纤维质组学共检测出1996种膳食纤维质。以B0为对应组,挑选B1、B2、B4和B6中的膳食纤维展开对比表现具体解析,共检测到374个DEPs。将火山图交互,并伴随着FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两标淮具体解析DEP。导致如1c-f所表明,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中别检测出22、33、73和140个DEPs,另外别调整6、11、32和84个,上涨16、22、41和5多个。聚类算法方案风险评估了的不同保鲜分阶段胸肌集体中膳食纤维质的表现,导致表明胸肌膳食纤维表现对比伴随着存储期限的提高而提高(图1g)。
图1| 各个食品冷藏精力的力量样件蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 区别冰箱的时间的腹肌样板文化差异蛋白酶探讨(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁枯死球蛋白肽的PRM一定量分享(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 通过KEGG丰度异同表达出核蛋白的铁生亡新机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱海洋生物提供了TMT降钙素原检测蛋清质组学工艺提供服务性,拜谱生态学已研发管理顺利完成并搭建了完美稳定的转录组学、蛋清组学、消化吸收组学并且几组学联和软件工艺提供服务性组织体制,欢迎致电咨询!
参阅医学文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.