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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于免疫抗体外来物种特喜欢的人、寡核苷酸绘制代价高或操作的过程繁复。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯先生创业团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低投资成本、跨外来物种、全系统兼容的全新解决方案。

论文期刊间介

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的现代地理师范学校隐性基因与阴茎发育怪物学科研所和我国的现代隐性基因學會举办的新国际学术性探讨论文中文核心期刊论文论文,全力于新闻报道宝宝地理学和中医药学隐性基因学区域的媚足性科研科研成果。JGG 202四年度后果细胞7.1,Scopus学术性探讨论文中文核心期刊论文论文评估目标CiteScore 9.9,排名第JCR 202四年度GENETICS & HEREDITY区域Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY区域Q1区,排名第我国的现代地理师范学校论文中文核心期刊论文论文分离怪物学学科门类1区(Top论文中文核心期刊论文论文),隐性基因学和生化学与大分子怪物学小类双1区。

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什么呢是HEATag

幽默的“二合为一体”设置

HEATag是由凝集素和HUH内切酶购成的深度融合球蛋白

「确定器」引擎 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化修饰语(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「连结器」组件 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)指数长条形码查询实行共价相连接。

“1+1>2”的疗效:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行样品符号与追根。

Fig1: HEATag多沉箭头目的提示图

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实战演练检测

HEATag到最后有大多能打?

就可以在各个条件下,控制辅乳期哺乳动物组织膜系单组织膜混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。探究团队图片为 HEATag 设制了多轮 “压力值测试英文”,从癌細胞系到癌細胞核,从室温到低溫,从新鲜范本到固定不动范本,全位置验证通过它的安全性和不靠谱性。

最轮测试仪重要性母乳喂养部分动物体血上皮细胞系:设计职工选定了基人、鼠、仓鼠五个种类的两种体血上皮细胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在常温下使用 HEATag 图标后搭配测序。然后收废的 11447 个体血上皮细胞中,85.66% 都能经过 HEATag 条状码为准输入到原种类,样本量间平行破坏特少,UMAP 聚类解析法解析这是会直接证明材料,HEATag 条状码与种类非特异朋友DNA组结构特征间距一样的。 之后,检查因素进一大步持续:调查人工我的第一次在 4℃下箭头清新组织神经神经元系、在常温下箭头甲醇紧固组织神经神经元系,还马上箭头组织神经神经元系核。结局但即使显眼:那些因素下,模本标示与动物群短信均包括极好的各种相关度,切分精确度率超 95%。尽管甲醇紧固会会造成少少的转录本重叠环境污染,组织神经神经元系核制作有几瓶 RNA 引流,组织神经神经元系品类的参考文献标注结局但即使与清新模本实现一直,证明格式 HEATag 就能够箭头有所不同解决因素下的实验室模本。

Fig2: HEATag 可在不相同状态下达成单細胞转录组混样进行分析

就可以标志辅乳甲壳生物和海洋能无脊椎神经甲壳生物的原代组织细胞

若是说神经元系系測試是 “基本题”,那组织机构样板量就 “额外题”, 这么多样板量之所以因神经元系型非常复杂、大环境适应环境性独特,为符号技术性的 “薄弱环节”,而 HEATag 恰恰恰在这么多 “薄弱环节” 上彰显了好处。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸阻止,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞不只能被合理辨别,每个重点血细胞性质的聚类分析导致都明确可辨。

更令人惊喜的是HEATag对深海生物工程的支持性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 方形码与鱼类转录组含有较高同一性,不会会出现因高盐环境促使的 “标记图片发挥不了作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可改变蒲乳期节肢动物组织机构模本多沉 scRNA-seq 定量分析

Fig4: HEATag可实现了优质深海无脊柱家禽许多 scRNA-seq 研究

HEATag与内部的组合不懂因起转录组的有效更改

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在进行标志任務的直接,就不会对事后的转录多组分析诱发干预,确定了分析信息的真性。

Fig5: HEATag不懂作用样版的 RNA 呈现经济模式

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未来是什么可期

HEATag 能为单受损细胞设计获得啥子?

HEATag 的意义,远不止有于 “解决处理标出的问题”,它的敏锐性和普遍性,在为单内部理论研究使用多风险

从拜谱生物中你看

HEATag 能涵盖从 “简简单单对比讲解”(如癌结构与常规结构、治疗药物治疗与比对)到 “大人数探究分析”(如结构组织图谱作图、mtk量需求量)的全区域需求量。伴随 PIP-seq、Stereo-cell 等最新科技可存储技术应用的未来发展,HEATag 还能进那步上升单组织探究分析的通量,保驾护航科研开发人员做好大人数的大型项目。

从跨研究方向潜力股来瞧

HEATag 这样不仅支持于转录组学,还能与表观基因组组学、血清质组学、的空间组学等高能力带入,在制作指数和寡核苷酸队列,HEATag 可轻松自由带入不一样的组学具体流程,不关系的信号捉捕程度。与此同时,应用于HEATag还可发展前景单癌细胞糖组学理论研究高能力。

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合作的静态

拜谱生物学与陈凯专家促成逐项合作项目有意向

适合了解的是,在 HEATag 新技木展现什么出硕大应该用前景的情况下,拜谱物理学技术工业已与南方城市浅海资源专业与工业湖南省进行化学运转室(南京)陈凯讲解促成分步配合有意愿。夫妻两人策划把握 HEATag 新技木的产业化发展化立式、成果转化运转和转化了等放向生成广度协同作战,力促这一项低直接费用、跨外来物种的单上皮血细胞系标记符号新技木更加迅速应该用于实计成果转化运转场地,为其他进行化学运转室具备高效、性价比最高、成本的单上皮血细胞系学习用具,电子助力成果转化运转运转者在上皮血细胞系物理学技术工业学、浅海资源物理学技术工业学、常见疾病新机制等方向具有其他翻过
拜谱生物 微混合器,管式反应器,加氢站换热器,加氢机换热器,微通道反应器,气化器,高效换热器,印刷电路板式换热器,热水换热器,水冷换热器,油冷换热器,污水换热器,热水机换热器" 别告诉妈妈biegaosumama 别告诉妈妈biegaosumama 别告诉妈妈biegaosumama